Kanton Basel-Stadt je osnovan 1833. godine. Ima dugu i zanimljivu istoriju. Već u srednjem kamenom dobu prije oko 130.000 godina je ovdje postojalo naselje. Pošto je Basel bio na strateški povoljnom mjestu, Rimljani su 30 godina prije Hrista na brdu Münsterhügel stacionirali svoju vojsku. Na istom mjestu se danas nalazi Basler Münster. Münster je ranije bio biskupska crkva, koja je osvještana 1019. godine. Zbog toga se na kantonalnom grbu Basela može vidjeti baselski štap. On predstavlja pastriski štap biskupa.
Univerzitet Basel je osnovan 1460. godine. Basel se razvio u centar za štampanje knjiga i humanizam. Sredinom 16. stoljeća su ovdje pobjegle mnoge migrantkinje i mnogi migranti iz Gornje Italije i Francuske. Oni su u Basel donijeli tkanje i farbanje svile. Iz toga su nastali današnji farmaceutski i hemijski koncerni. Basel-Stadt i Basel-Landschaft su se nakon ratnih sukoba razdvojili 1833. godine. Danas je Kanton Basel-Stadt centar za kulturu, trgovinu i privredu sa težištem u Life Scinces.